新疆维吾尔族汉人（尤其是高昌汉人）父系

新疆吐鲁番维吾尔族汉人父系

1. Q-M120 鄯善县

2. N-M1819-Y72712 高昌区

3. O-Page59-F3323 托克逊县

4. O-PK4-MF117767 高昌区

5. O-JST002611-MF7188 高昌区

6. O-JST002611-MF6935 高昌区

7. O-JST002611-F325* 高昌区

8. O-M117-Y72947 托克逊县

9. O-F114-MF3350 托克逊县

10. O-F114-MF28309 托克逊县

11. O-F114-FGC16921 高昌区

12. O-F114-F14163 高昌区

根据历史记录，吐鲁番是汉人在西域最重要的定居点，汉人在此建立了长达几百年的汉人高昌国。而当地汉人的前身相当一部分是西域、甘肃的西汉驻军。很长一段时间内，当地都是汉文化主导，高昌魏碑、阿斯塔那古墓都是当地汉文化的杰作。安史之乱后，吐蕃切断其与内地联系，回鹘人从漠北南下，当地所有汉人完成回鹘化，并跟随回鹘人完成部分吐火罗化，彻底融入当地。

汉人父系在吐鲁番，绝大多数在高昌区，其次托克逊县，鄯善县极为稀少。这说明新疆维吾尔族的基因混合程度比较低。也证实吐鲁番汉人父系大多来自高昌汉人。

通过对各父系大支地理分布观察，吐鲁番维吾尔族中的汉人父系最主要来源是华北，其次分别是东部、华中。这一结论与黑水国的古DNA的检测结果有相似的部分，但也有很大不同：华北来源的太多了；而且黑水城、佛爷庙的N1a、Q高频，在吐鲁番汉人中没有体现。

最有意思的是O-MF117767（闽西粤东涂氏家族，1060年前）和O-Y72947（东南林氏分支，1470年前），两个最为东南的分支，行踪非常诡异。但仔细看就能发现前者的真实身份。这支悬挂了不少样本，真实年份2330～1060年前，其中就有湖北的，说明他大概率是来自华中的西汉驻军。东南林氏那支难以解释，只有一种可能是唐朝移民或驻军。